MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022221	CAC	3	9	204	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435370
2	NC_022221	ACC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435370
3	NC_022221	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435371
4	NC_022221	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	537435371
5	NC_022221	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435371
6	NC_022221	GAT	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435371
7	NC_022221	A	6	6	491	496	100 %	0 %	0 %	0 %	537435371
8	NC_022221	CGG	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435371
9	NC_022221	T	6	6	545	550	0 %	100 %	0 %	0 %	537435371
10	NC_022221	GC	3	6	575	580	0 %	0 %	50 %	50 %	537435371
11	NC_022221	CTG	2	6	664	669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435371
12	NC_022221	CGC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435371
13	NC_022221	A	6	6	716	721	100 %	0 %	0 %	0 %	537435371
14	NC_022221	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	537435371
15	NC_022221	CGC	2	6	858	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435371
16	NC_022221	CCG	2	6	908	913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435371
17	NC_022221	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435371
18	NC_022221	CCG	3	9	965	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435371
19	NC_022221	GCC	2	6	979	984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435371
20	NC_022221	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435371
21	NC_022221	GCT	2	6	1068	1073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435371
22	NC_022221	CT	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	537435371
23	NC_022221	TTC	2	6	1127	1132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435371
24	NC_022221	CGA	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435371
25	NC_022221	AAC	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435371
26	NC_022221	GAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435371
27	NC_022221	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435371
28	NC_022221	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435371
29	NC_022221	GGT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435371
30	NC_022221	TCC	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537435371
31	NC_022221	TG	3	6	1417	1422	0 %	50 %	50 %	0 %	537435371
32	NC_022221	GC	3	6	1436	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	537435371
33	NC_022221	CCG	2	6	1446	1451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435371
34	NC_022221	GCT	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435371
35	NC_022221	TGT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435371
36	NC_022221	TTC	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435371
37	NC_022221	AATATC	2	12	1606	1617	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	537435371
38	NC_022221	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435371
39	NC_022221	TGG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435371
40	NC_022221	ACG	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435371
41	NC_022221	CCA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435371
42	NC_022221	CGG	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435371
43	NC_022221	CGG	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435371
44	NC_022221	GAA	2	6	1809	1814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435371
45	NC_022221	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435371
46	NC_022221	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435371
47	NC_022221	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435371
48	NC_022221	TCG	2	6	2086	2091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435371
49	NC_022221	ACT	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435371
50	NC_022221	CGC	3	9	2118	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435371
51	NC_022221	CTG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435371
52	NC_022221	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435371
53	NC_022221	CT	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	537435371
54	NC_022221	TC	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	537435371
55	NC_022221	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	537435371
56	NC_022221	CG	3	6	2345	2350	0 %	0 %	50 %	50 %	537435371
57	NC_022221	GAC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435371
58	NC_022221	GCC	2	6	2524	2529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435371
59	NC_022221	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435371
60	NC_022221	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	537435371
61	NC_022221	TAT	2	6	2686	2691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435371
62	NC_022221	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435371
63	NC_022221	ATG	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435371
64	NC_022221	CGG	3	9	2741	2749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435371
65	NC_022221	AGC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435372
66	NC_022221	GCC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435372
67	NC_022221	A	7	7	3060	3066	100 %	0 %	0 %	0 %	537435372
68	NC_022221	CGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435372
69	NC_022221	CGC	2	6	3112	3117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435372
70	NC_022221	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	537435372
71	NC_022221	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435372
72	NC_022221	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435372
73	NC_022221	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435372
74	NC_022221	ATT	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435372
75	NC_022221	CAG	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435372
76	NC_022221	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435372
77	NC_022221	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	537435372
78	NC_022221	GCC	2	6	3464	3469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435372
79	NC_022221	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435372
80	NC_022221	CG	4	8	3503	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	537435372
81	NC_022221	GC	3	6	3558	3563	0 %	0 %	50 %	50 %	537435372
82	NC_022221	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435372
83	NC_022221	AGT	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435372
84	NC_022221	CAG	2	6	3809	3814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435373
85	NC_022221	T	8	8	3819	3826	0 %	100 %	0 %	0 %	537435373
86	NC_022221	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435373
87	NC_022221	GCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435373
88	NC_022221	CG	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	537435373
89	NC_022221	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435373
90	NC_022221	GCG	2	6	4098	4103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435373
91	NC_022221	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	537435373
92	NC_022221	GTC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435373
93	NC_022221	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	537435373
94	NC_022221	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435373
95	NC_022221	TGA	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435373
96	NC_022221	GAA	2	6	4331	4336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435373
97	NC_022221	GCC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435373
98	NC_022221	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435373
99	NC_022221	CTG	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435373
100	NC_022221	CGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435373
101	NC_022221	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	537435373
102	NC_022221	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	537435373
103	NC_022221	GGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435373
104	NC_022221	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435373
105	NC_022221	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	537435373
106	NC_022221	GCG	2	6	4718	4723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435373
107	NC_022221	ACA	2	6	4741	4746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435373
108	NC_022221	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435373
109	NC_022221	AAAG	2	8	4880	4887	75 %	0 %	25 %	0 %	537435373
110	NC_022221	GCT	2	6	4954	4959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435373
111	NC_022221	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435373
112	NC_022221	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	537435373
113	NC_022221	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435373
114	NC_022221	TGA	3	9	5001	5009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435373
115	NC_022221	TG	3	6	5148	5153	0 %	50 %	50 %	0 %	537435374
116	NC_022221	TCA	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435374
117	NC_022221	AAT	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435374
118	NC_022221	TCA	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435374
119	NC_022221	CG	3	6	5251	5256	0 %	0 %	50 %	50 %	537435374
120	NC_022221	T	6	6	5258	5263	0 %	100 %	0 %	0 %	537435374
121	NC_022221	ACC	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435374
122	NC_022221	TCA	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435374
123	NC_022221	TTC	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435374
124	NC_022221	CAC	3	9	5384	5392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435374
125	NC_022221	CG	3	6	5470	5475	0 %	0 %	50 %	50 %	537435374
126	NC_022221	AG	3	6	5552	5557	50 %	0 %	50 %	0 %	537435374
127	NC_022221	TGT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435374
128	NC_022221	CAAAAT	2	12	5578	5589	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	537435374
129	NC_022221	CGT	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435374
130	NC_022221	GCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435374
131	NC_022221	GCT	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435374
132	NC_022221	AATCAG	2	12	5873	5884	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	537435374
133	NC_022221	CG	3	6	5971	5976	0 %	0 %	50 %	50 %	537435375
134	NC_022221	ACC	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435375
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260	NC_022221	AGA	2	6	13083	13088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435381
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262	NC_022221	GAA	2	6	13121	13126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435381
263	NC_022221	CTG	2	6	13217	13222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435381
264	NC_022221	GAA	2	6	13244	13249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435381
265	NC_022221	TGA	2	6	13270	13275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435381
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280	NC_022221	GGC	2	6	13911	13916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435382
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381	NC_022221	AGAGC	2	10	19374	19383	40 %	0 %	40 %	20 %	537435388
382	NC_022221	CGA	2	6	19389	19394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435388
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390	NC_022221	GAA	2	6	19747	19752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435388
391	NC_022221	GAT	2	6	19771	19776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435388
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395	NC_022221	CGG	2	6	19935	19940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435388
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462	NC_022221	AGCGAC	2	12	26510	26521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435392
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